Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6430550D23RikE9Q1X6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
6430550D23RikE9Q1X6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430550D23RikE9Q1X6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms