Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pdzd2E9Q1M1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzd2E9Q1M1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms