Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Scaf11E9PZM7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scaf11E9PZM7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Scaf11E9PZM7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Scaf11E9PZM7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms