Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

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Length 4,059 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pkhd1E9PZ36 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1E9PZ36 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1E9PZ36 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms