Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rsph10bE9PYQ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rsph10bE9PYQ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rsph10bE9PYQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rsph10bE9PYQ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms