Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc175E9PVB3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc175E9PVB3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc175E9PVB3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc175E9PVB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms