Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930467E23RikD3Z1P8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930467E23RikD3Z1P8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms