Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccnyl1D3YUJ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccnyl1D3YUJ3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccnyl1D3YUJ3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms