Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam71aB7XG49 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam71aB7XG49 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71aB7XG49 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms