Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia1B2RXQ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppfia1B2RXQ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppfia1B2RXQ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia1B2RXQ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms