Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Abcc8B2RUS7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Abcc8B2RUS7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
Abcc8B2RUS7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Abcc8B2RUS7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Abcc8B2RUS7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Abcc8B2RUS7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC44■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms