Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usf3B2RUQ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Usf3B2RUQ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms