Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt4B2RU40 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrt4B2RU40 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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