Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfc3h1B2RT41 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfc3h1B2RT41 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfc3h1B2RT41 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms