Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf518bB2RRE4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf518bB2RRE4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf518bB2RRE4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms