Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnfrsf25B1AWN9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf25B1AWN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms