Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phactr2B1AVP0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phactr2B1AVP0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phactr2B1AVP0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms