Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a6B1AVK5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a6B1AVK5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a6B1AVK5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms