Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PtpruB1AUH1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtpruB1AUH1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtpruB1AUH1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms