Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700042G07RikB1AUF7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700042G07RikB1AUF7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms