Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmem235B1AQL3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem235B1AQL3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem235B1AQL3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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