Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Skint2A7XUX6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Skint2A7XUX6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Skint2A7XUX6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms