Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skint3A7TZF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint3A7TZF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Skint3A7TZF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Skint3A7TZF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms