Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Skor2A7M7C7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skor2A7M7C7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Skor2A7M7C7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.3 ms