Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930435E12RikA6X8Z9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms