Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5640A3KG49 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5640A3KG49 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5640A3KG49 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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