Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r232A2RTT5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r232A2RTT5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms