Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34c4A2ANA3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn34c4A2ANA3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn34c4A2ANA3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms