Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GabreA2AMW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
GabreA2AMW3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GabreA2AMW3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms