Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn3A2ALK8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn3A2ALK8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpn3A2ALK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1635.6 ms