Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc163A2AGD7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms