Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprfA2A8L5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprfA2A8L5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms