Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam71e1A1L3C1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Fam71e1A1L3C1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam71e1A1L3C1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms