Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trav12-2A0N8N6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trav12-2A0N8N6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trav12-2A0N8N6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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