Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUK1

AW822073, Expressed sequence AW822073, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW822073A0A0N4SUK1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AW822073A0A0N4SUK1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AW822073A0A0N4SUK1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AW822073A0A0N4SUK1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 610.2 ms