Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gm5538W4VSP6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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