Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Crlf3Q9Z2L7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Crlf3Q9Z2L7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Crlf3Q9Z2L7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Crlf3Q9Z2L7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Crlf3Q9Z2L7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Crlf3Q9Z2L7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Crlf3Q9Z2L7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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