Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mbd2Q9Z2E1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms