Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms