Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp1a4Q9WV27 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp1a4Q9WV27 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms