Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms