Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh11Q9QYF1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh11Q9QYF1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh11Q9QYF1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh11Q9QYF1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh11Q9QYF1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh11Q9QYF1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rdh11Q9QYF1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms