Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limd1Q9QXD8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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