Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Trpc5Q9QX29 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpc5Q9QX29 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trpc5Q9QX29 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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