Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1eQ9JMK2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms