Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc2lQ9JME7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms