Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gde1Q9JL56 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms