Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfra4Q9JJT2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gfra4Q9JJT2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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