Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms