Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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OtofQ9ESF1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
OtofQ9ESF1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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